Cryo-EM : Imagerie de particules uniques

Description

Au cours de la dernière décennie, l'intérêt pour la cryo-microscopie électronique s'est accru grâce aux développements révolutionnaires de l'instrumentation. Cela s'est traduit par une croissance exponentielle de la production de structures utilisant l'analyse de particules uniques (SPA). En complément du cours destiné à enseigner aux utilisateurs le fonctionnement des systèmes haut de gamme de la Nano-Imaging Core Facility (NICF-IP), nous présentons maintenant un nouveau cours sur le traitement des données SPA à la plus haute résolution.

Ce cours

- apprendra aux utilisateurs comment utiliser les logiciels de reconstruction les plus couramment utilisés comme Relion et CryoSPARC.

- sera essentiellement pratique et comporte quelques leçons théoriques données par des experts du domaine sur la façon de valider vos données.

Les participants utiliseront les clusters et serveurs de calcul de haute performance de l'Institut Pasteur sous la supervision des instructeurs de l'IP - Université Paris-Cité et des enseignants invités Jose Maria Carazo et Carlos Oscar Sorzano, tous deux développeurs de logiciels de reconstruction SPA. Le cours offrira une pratique approfondie sur la base du traitement d'images à l'aide d'un ensemble de tests. Vous utiliserez Relion et Cryo-SPARC, suivis d'une introduction à Scipion. Les participants auront la possibilité de traiter les ensembles de données qu'ils ont collectés au NICF-IP. Le traitement de jeux de données obtenus dans d'autres installations peut être discuté avec les organisateurs.  Le participant approfondira la validation du résultat et comment s'assurer que les résultats peuvent être fiables.

Interressé.e par la CryoEM? Lady Pipette, doctorante à l'Institut Pasteur l'explique en musique!