Cours Pasteur

Cryo-ET : Traitement d'images pour la tomographie/microscopie électronique

Ce cours s'adresse aux doctorants, post-doctorants, ingénieurs et chercheurs qui ont une certaine expérience en (Cryo-)EM et qui souhaitent utiliser la (Cryo-)ET dans un avenir proche. Les candidats qui disposent déjà de séries d'inclinaison pour le traitement seront prioritaires. Ce cours vise à fournir tout le bagage théorique nécessaire et les outils utiles pour rendre les participants autonomes en tomographie électronique.

Informations pratiques

  • 1 semaine
  • 21 juin 2027 - 25 juin 2027
  • Institut Pasteur
  • Anglais

Contacts

CryoET@pasteur.fr

Inscriptions

  • Date limite : 1 mars 2027
  • Participant.e.s : 14

Accréditations :

  • Formation continue du personnel pasteurien
  • Diplôme de l'Institut Pasteur

Description

La tomographie électronique combinée au traitement d'images est l'une des méthodes les plus puissantes pour étudier les détails cellulaires en 3D. Les études in situ peuvent révéler des informations supplémentaires importantes sur les macromolécules et leurs environnements complexes, leurs conformations adoptées, leur recrutement sur des sites particuliers et leurs interactions avec d'autres molécules clés ou ultrastructures. 

Ce cours d'une semaine vise à introduire les concepts de base de l'analyse d'images et de l'expérience pratique des reconstructions tomographiques pour différents besoins : traitement de séries d'inclinaison à faible dose avec et sans repères pour l'annotation de volumes 3D ou le moyennage de sous-tomogrammes. Des sessions d’introduction à la tomographie, aux alignements de cadres, à la reconstruction de tomogrammes, au débruitage, à l'annotation de volumes et au prélèvement de particules pour l'analyse de sous-tomogrammes seront également abordées.

 Interressé.e par la CryoEM? Lady Pipette, doctorante à l'Institut Pasteur l'explique en musique!

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Directeur.rice.s

GAZI Anastazia - Institut Pasteur
SARTORI-RUPP Anna - Institut Pasteur

Membres du comité de cours

CHERIET Samia - Institut Pasteur, Paris
GAZI Anastazia - Institut Pasteur
SARTORI-RUPP Anna - Institut Pasteur