Cryo-ET : Traitement d'images pour la tomographie/microscopie électronique
Informations pratiques
- 1 semaine
- 21 juin 2027 - 25 juin 2027
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Institut Pasteur
- Anglais
Contacts
Inscriptions
Accréditations :
- Formation continue du personnel pasteurien
- Diplôme de l'Institut Pasteur
Description
La tomographie électronique combinée au traitement d'images est l'une des méthodes les plus puissantes pour étudier les détails cellulaires en 3D. Les études in situ peuvent révéler des informations supplémentaires importantes sur les macromolécules et leurs environnements complexes, leurs conformations adoptées, leur recrutement sur des sites particuliers et leurs interactions avec d'autres molécules clés ou ultrastructures.
Ce cours d'une semaine vise à introduire les concepts de base de l'analyse d'images et de l'expérience pratique des reconstructions tomographiques pour différents besoins : traitement de séries d'inclinaison à faible dose avec et sans repères pour l'annotation de volumes 3D ou le moyennage de sous-tomogrammes. Des sessions d’introduction à la tomographie, aux alignements de cadres, à la reconstruction de tomogrammes, au débruitage, à l'annotation de volumes et au prélèvement de particules pour l'analyse de sous-tomogrammes seront également abordées.
Interressé.e par la CryoEM? Lady Pipette, doctorante à l'Institut Pasteur l'explique en musique!
Directeur.rice.s
GAZI Anastazia - Institut Pasteur
SARTORI-RUPP Anna - Institut Pasteur
Membres du comité de cours
CHERIET Samia - Institut Pasteur, Paris
GAZI Anastazia - Institut Pasteur
SARTORI-RUPP Anna - Institut Pasteur